遠い昔にはたびたび発見されたが今や絶滅した希少動物エンゲーリの痕跡を追い、深い森の中に入った探検家「Ｚ」。探索途中に夜を過ごす場所を探していた彼は偶然ある廃墟に至る。

その場所は一時栄えていたが、今やその痕跡だけ残った廃墟以外に何もなかった。Ｚが空しさにため息を付いたその時、どこかで犬が吠える声が響いた。

いつのまにかＺを取り囲む一群の犬たち。休まず吠える犬たちを落ち着かせ、その向こうに視線を向けると、ある少女がＺを眺めている。

Ｚはふと、少女の青い瞳の中に自分の瞳が写っていることに気付く。

清らかだが悲しいその瞳に何かあることを覚えたＺは、少女に導かれ少女の家で一夜を過ごすことになる。その次の日からは二人でエンゲーリを探す旅に出たのだが···